人巨细胞病毒蛋白质组测序完成
时间:2012-11-26 13:23:37 来源:三济生物 点击:
来自:生物无忧
美国和德国研究人员进行的一项新研究增加了我们对人巨细胞病毒(HCMV)以及它对所感染寄主细胞的操纵机制的理解。
HCMV是一种非常常见的疱疹病毒,它的感染率为50-100%,其感染后通常不会产生疾病表征,并可能会潜伏多年。HCMV感染在发展中国家比在发达国家更常见.该病毒可以导致新生婴儿先天畸型,并给免疫力低下的患者带来严重的甚至致命的影响。另外,还有研究显示该病毒可能在癌症的发展过程中发挥一定作用。
美国旧金山加利福尼亚大学Jonathan Weissman实验室的Noam Stern-Ginossar领导了这一研究,来自美国和德国的研究人员组成的团队观察了这一病毒的蛋白组,即调查了所有表达的蛋白.研究人员认为,基因组编码的潜在蛋白质图谱很多是基于计算机模型的预测,这是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因组被首次测序成功,之后又有另外16种病毒株被测序。HCMV是一个特别大的病毒基因组,大约有240000个碱基对。
该研究小组对人类成纤维细胞被HCMV感染后的细胞核糖体位置进行了蛋白质图谱的测定。核糖体是细胞内负责蛋白生产的细胞器。之后,研究人员用质谱的方法确定了这些预测蛋白是否存在。这一研究确定了之前尚未确定的编码于基因组中的上百种蛋白。
编码蛋白的DNA片段被称为“开放阅读框”。之前的研究根据HCMV基因组的序列,已经预测出了大约200种可能存在的阅读框.在这一新研究中,研究小组发现了在预测阅读框中的一些编码极短蛋白序列(由100个甚至更少的氨基酸组成)的开放阅读框。他们还发现,一些开放阅读框是位于另一些阅读框内部的。这一蛋白组的复杂性令他们非常惊讶和意外。
解病毒基因组表达的蛋白质情况能够帮助我们确定这些病毒是如何影响寄主细胞的,并帮助我们找出抑制它们感染寄主细胞的方法。
这篇文章发表在Science杂志上,研究小组提到:他们所用到的核糖体基因组图谱以及质谱分析相结合的方法还可以用于确定其它复杂的病毒蛋白组。
美国和德国研究人员进行的一项新研究增加了我们对人巨细胞病毒(HCMV)以及它对所感染寄主细胞的操纵机制的理解。
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HCMV是一种非常常见的疱疹病毒,它的感染率为50-100%,其感染后通常不会产生疾病表征,并可能会潜伏多年。HCMV感染在发展中国家比在发达国家更常见.该病毒可以导致新生婴儿先天畸型,并给免疫力低下的患者带来严重的甚至致命的影响。另外,还有研究显示该病毒可能在癌症的发展过程中发挥一定作用。
美国旧金山加利福尼亚大学Jonathan Weissman实验室的Noam Stern-Ginossar领导了这一研究,来自美国和德国的研究人员组成的团队观察了这一病毒的蛋白组,即调查了所有表达的蛋白.研究人员认为,基因组编码的潜在蛋白质图谱很多是基于计算机模型的预测,这是很不完全的。
在20年前,HCMV的基因组被首次测序成功,之后又有另外16种病毒株被测序。HCMV是一个特别大的病毒基因组,大约有240000个碱基对。
该研究小组对人类成纤维细胞被HCMV感染后的细胞核糖体位置进行了蛋白质图谱的测定。核糖体是细胞内负责蛋白生产的细胞器。之后,研究人员用质谱的方法确定了这些预测蛋白是否存在。这一研究确定了之前尚未确定的编码于基因组中的上百种蛋白。
编码蛋白的DNA片段被称为“开放阅读框”。之前的研究根据HCMV基因组的序列,已经预测出了大约200种可能存在的阅读框.在这一新研究中,研究小组发现了在预测阅读框中的一些编码极短蛋白序列(由100个甚至更少的氨基酸组成)的开放阅读框。他们还发现,一些开放阅读框是位于另一些阅读框内部的。这一蛋白组的复杂性令他们非常惊讶和意外。
解病毒基因组表达的蛋白质情况能够帮助我们确定这些病毒是如何影响寄主细胞的,并帮助我们找出抑制它们感染寄主细胞的方法。
这篇文章发表在Science杂志上,研究小组提到:他们所用到的核糖体基因组图谱以及质谱分析相结合的方法还可以用于确定其它复杂的病毒蛋白组。