包括5位来自Simon Fraser大学在内的14位北美科学家,破解了人类基因组上复杂区域遗传代码,从而开拓了免疫学研究的新领域。
研究人员发现,大量的抗体基因在相互协调和对外免疫上确实存在因人而异的现象,这意味着,即便从整个人群角度设计药物、医疗方案和疫苗接种,人体对其的反应也可能是不一致的。
完成对人类基因组上长度达1百万bp的高度重复的DNA序列(免疫球蛋白重链IGH的遗传位点)测序后,科学家发现了,种族差异可能会影响免疫力。纽约Mount Sinai 大学医学院博士后Corey Watson 研究员称:“我们发现,IGH遗传位点的片段在一些人身上发生缺失现象,而在另一些人身上又出现在基因组上,种族差异决定了该遗传片段的缺失或存在。”
科学家们早就知道,作为最高产的DNA重组区,IGH-链的遗传位点提供了50多个具有差异性的编码抗体的基因,以供人体B细胞防御感染和疾病。
在新的数据分析技术的帮助下,研究人员首次从根本上改善了这项研究,截至到目前,已利用零散片段大致地拼装了人类基因组IGH-链的遗传图谱。Watson称:“由于这是最为完整的人类IGH序列,我们的序列已整合到官方的人类基因组组合项目中(human genome project assembly)。”
利用个体的单一染色体,最新研究测序了IGH位点上编码抗体的所有可能的基因类型,同时也发现了该位点上编码基因出现了11种遗传组合形式(较大片段DNA的缺失和插入)。这一情况决定了抗体基因的遗传多样性,在某些情况下也关联到疾病易感性。
在观察425位来自亚洲、非洲和欧洲后裔的染色体后,围绕着DNA片段插入和缺失进行研究,科学家发现了抗体组成与种族之间的关联。
Watson强调称:“这项研究表明,过去的岁月中不同的种族人群接触了特定环境的病原体,引起了DNA的插入或缺失,从而可能影响了疾病风险。研究结果表明,抗体研究需要考虑到所选取的种族DNA样本。”
在这项研究的推动下,科学家将进一步探索与IGH相关的抗体基因差异性如何影响不同人群对病毒(如流感和艾滋病病毒)的防御能力。
文章来源:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002929713001122