创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”
时间：2016-04-01 09:12:09 来源：转化医学 点击：
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液态活检是肿瘤精准医疗领域炙手可热的明星技术。循环肿瘤DNA（ctDNA）高通量测序技术是液态活检的一种，也是最具前景的。
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安可济（AccuraGen）公司联合创始人兼科研总监赵奇志（Grace Zhao）博士
在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议（The Molecular Medicine Tri-Conference）上，安可济（AccuraGen）公司的联合创始人兼科研总监赵奇志（Grace Zhao）博士首次发表了安可济独创的ctDNA高通量测序技术FireflyTM的原理，及其和国际主流技术的性能比较，证明基于FireflyTM技术开发的基因液态活检产品可能是目前国际上性能最好的ctDNA高通量测序产品。这意味着由中国海外学者创始的这家国际公司在肿瘤液态活检领域走在了世界前列。日前，国际知名基因组专业网站GenomeWeb对此做了报道。旧金山分子医学三方会议已有23年历史，聚焦分子医学，涵盖新药研发、基因组学、体外诊断、生物信息、商务策略、平台开发等多领域，是诊断方法与新药研发领域相关人士不可错过的一流国际盛会。
精确测序ctDNA的两大技术障碍
液态活检是肿瘤精准医疗领域炙手可热的明星技术。循环肿瘤DNA（ctDNA）高通量测序技术是液态活检的一种，也是最具前景的。它只需像化验肝肾功能那样采集静脉血，即可对全身的肿瘤基因信息进行精确测定，基于肿瘤基因信息，就可以指导抗肿瘤药物选用、疗效评估、预后判断，甚至早期发现和早期诊断。然而，精确测序ctDNA存在两个巨大技术障碍：首先是血浆中的ctDNA含量极低，做不了几个检测反应。其次是二代测序背景噪声很高，用常规建库测序方法肿瘤信号完全淹没在背景噪声中。全球这一领域的顶尖高手都在致力于攻克这两个难题。
与组织测序验证率高达98%的ctDNA检测技术
在3月11日的循环肿瘤DNA分会场上，赵奇志博士主持了会议，并报告了FireflyTM技术的原理与进展。安可济采用单链环化DNA滚环复制串联重复确认法，取代国际主流的双链DNA分子条码扩增比对确认法，在解决了微量的循环肿瘤DNA扩增难题的同时极大地提高了检测灵敏度和特异性。基于该技术开发的涵盖61个基因测序的安可行TM产品已经完成了性能验证，正在中国推进针对不同癌症种类的6个临床合作研究项目。临床研究结果证明了在晚期肺癌病例中，ctDNA与组织测序98%病例符合率和高达87%位点符合率。通过对胰腺癌的近两年的研究观察，发现了ctDNA突变谱与预后和化疗获益率之间的相关性。在直结肠癌指导用药研究中，发现了明确的ctDNA与疗效和复发的相关性。这些研究成果已经投稿今年六月的美国临床肿瘤学会（ASCO）年会，也为下一步产品开发奠定了坚实的基础。
液态活检可反映肿瘤全貌
若干年前，苹果创始人乔布斯花10万美金进行肿瘤基因测序，还只能取材肿瘤组织活检标本，这在实际应用中有很大局限。而只需采血的液态活检则应用极为方便。不仅如此，组织活检像盲人摸象或是切蛋糕一样，只检测了肿瘤的一部分，而循环血中的ctDNA则能反映肿瘤全貌，这对全面了解肿瘤特征、精准给药提供了前所未有的视野。目前，两年多年前初创于美国加州Palo Alto的安可济公司已经迁至Menlo Park，形成了国际一流的研发团队，同时，在中国上海设立了首个医学检验所和商业推广机构。据悉，该公司近期将有进一步发展布局，十分值得期待
