Nature：测序揭示转移性肿瘤有何大不同
时间：2017-08-07 11:28:44 来源：生物通 点击：
美国密歇根大学的研究人员近期对500例的转移性肿瘤开展全外显子组和全转录组测序，发现它们带有的突变比原发性肿瘤更多。这项成果于8月2日发布在《Nature》杂志上。
同时，研究人员还发现，相当一部分癌症转移的患者带有生殖系突变，这增加了他们的癌症风险。此外，他们指出，转移性肿瘤可根据其mRNA表达谱分成两组，而这些亚型似乎与肿瘤对治疗的反应有关。
这篇文章的通讯作者、密歇根大学的Arul Chinnaiyan表示：“我们的研究结果强调了对转移性肿瘤进行新鲜活检的重要性。在转移和治疗的过程中，肿瘤也在不断发展。我们需要对转移性肿瘤进行活检，然后提出治疗方法，而不是使用原发性肿瘤的存档组织。”
研究团队对500名转移性癌症患者的活检样本和生殖系DNA进行测序，这些样本代表20种癌症，最常见的是转移性前列腺癌、乳腺癌和软组织肉瘤。最频繁的转移灶是肝、淋巴结、肺和骨。
平均而言，研究人员在每位患者中观察到119个体细胞突变，与大多数癌症的原发性肿瘤相比，突变的数量明显增加。他们将这种增加归因于癌症的侵袭性，累积突变的时间延长，以及治疗的影响。
不过，尽管突变的数量增加，但研究人员发现，只有少数基因以高频率突变。大多数时候，这些突变集中在抑癌基因TP53、CDKN2A、PTEN和RB1，或癌基因PIK3CA、AR和KRAS。
Chinnaiyan及其同事也调查了这些患者的致病性生殖系突变。他们发现，12%的患者带有可能致病的遗传突变。最终，他们定位到63个可能致病的生殖系突变。三分之二的突变位于参与DNA修复的基因，如MUTYH、BRCA2、CHEK2和BRCA1。
他们将这些突变的频率与外显子整合联盟（ExAC）的数据集进行比较，发现此次分析的队列人群更有可能携带致病的生殖系突变。
与此同时，研究人员也分析了这些转移性癌症患者的转录组。他们发现，与癌症相关的转录程序增加。与正常组织相比，转移性肿瘤的增殖、应激反应和代谢增加。同时，他们将肿瘤分成两个亚型，一个是与炎症相关，另一个与增殖相关。
“并非所有的转移都是相同的，”Chinnaiyan谈道。“不同通路的推动，让它们彼此完全不同，有些是高度增殖，有些则倾向于分化。这种互相排斥的现象是一个新发现，有望指导我们开发出新型的疗法。”
